在网络小说中，混鲲祖师又名鲲鹏祖师。混沌世界期间，在混沌中孕育了许许多多大大小小的生灵。不知在什么时候，鸿钧大道显化，在紫霄宫中说开天辟地，动转造化之经义。而在紫霄宫中听讲的位子是有限的，鲲鹏好不容易得到了一个位子，坐在红云祖师的身侧。
《佛本是道》鲲鹏祖师形象
红云祖师向来心善，把这个不易得到的位子让给了准提道人。谁知准提道人自己有位置后还想要帮师兄接引道人抢个位置，于是盯上了鲲鹏。不久，准提道人与师兄接引道人一同打败了鲲鹏祖师，使接引道人成功取代了鲲鹏，获得了在紫霄宫中听道的机会。此事因红云祖师而起，于是鲲鹏祖师就把这个仇算在红云老祖身上。
在盘古开天辟地后，鲲鹏跟随东皇太一入主了洪荒天庭。被封为了亿万妖族之师，号鲲鹏祖师，又称妖师。一日，鲲鹏前往火云宫欲杀红云祖师。红云祖师不解，鲲鹏祖师当面质问其为何将道位让予准提，害他受此劫难。红云不好辩解，只能先行抵挡。
鲲鹏祖师乃妖族妖师，法力自然在红云之上。但是先前被准提等人所伤，一时难分高下。过了许久，鲲鹏祖师渐渐占了上风，红云渐渐不敌，于是舍弃肉身逃跑。但鲲鹏祖师仍紧追不舍，损好几个元会的法力去击杀红云祖师元神，红云祖师虽受东皇太一等人相助，但元神依然受了重创，不得不转世投胎重修。
而鲲鹏祖师最后在巫妖大战中逃跑，隐居在天界极北之地，银河源头北冥汪洋之中潜修。
混鲲祖师和鸿钧老祖
混鲲祖师和鸿钧老祖是师兄弟关系，同为创始元灵的座下弟子。这是网络小说中的人物关系设定，并没有历史书籍记载。鸿钧老祖是创始元灵的大弟子，而混鲲祖师则是其二弟子，这是第一种说法。第二种说法是混鲲祖师曾在鸿钧老祖座下听讲，算是鸿钧老祖的弟子，但并未亲传。
混鲲祖师像
关于混鲲祖师和鸿钧老祖的所有事迹都是网络小说或民间传说，并不是中国的正统神话。
混鲲祖师在现代洪荒小说中又名鲲鹏祖师，是东皇太一和天帝帝俊时期的妖族妖师。其原型为《庄子·逍遥游》中的鲲鹏：北冥有鱼，其名为鲲。鲲之大，不知其几千里也；化而为鸟，其名为鹏。鹏之背，不知其几千里也；怒而飞，其翼若垂天之云。是鸟也，海运则将徙于南冥。
在小说《封神演义》中，鸿钧祖师就是“大道”的代表，是太上老君、元始天尊、通天教主的师傅。此三人出师后，分别掌管人、阐、截三教。传说盘古开天死后，元神一分为三，分别是太上老君、元始天尊和通天教主。然而这三人被鸿钧道人发现并点化收为弟子，这么说来，鸿钧老祖还算的上是盘古的师傅。
在小说《佛本是道》中，鸿钧祖师大道显化，在紫霄宫中开讲。盘古、女娲和东皇太一为其亲传弟子。其余仙、妖及各种生灵在其坐下听讲的不在少数，最后未成道者唯有盘古和东皇太一二人。
混鲲祖师的师傅
在网络小说中《创始元灵》中，混鲲祖师为创始元灵的弟子。创始元灵坐下有四大弟子：大弟子鸿钧老祖，修“玄清气”；二弟子混鲲祖师，修“玄灵气”；三弟子女娲，修“玄空气”；四弟子陆压道君，修“玄明气”。
创始元灵像
传说宇宙最开始诞生的时候，有一个先天混元的元灵，灵窍初开，渐具神智。这个元灵不经意间在西昆仑得到了宇宙之初的造化神器，经过不知几世修行，终于修得道法。这个元灵便是创始元灵了。在漫长难耐的混沌宇宙中，创始元灵成为宇宙间唯一的一个“清醒者”，忍受着难以想象的孤独寂寞。直到不知何时，又出现了四个形象各异的生灵。
这四个生灵便是鸿钧、混鲲、女娲和陆压了，这便是第二代弟子。鸿钧老祖门下又有太上老君、元始天尊、通天教主等弟子；混鲲祖师门下又有接引道人和准提道人等弟子；女娲娘娘门下又有广寒仙子、后土娘娘等弟子，这些便是第三代弟子。而后接引道人座下弟子无数，准提道人亦有弟子孙悟空等，元始天尊门下又有十二金仙等弟子，通天教主座下又有二十四星宿、雷公电母等弟子，这些就已经是第四代弟子了。
以上都是网络小说《创始元灵》中对混鲲祖师师傅的介绍，但其实在中国传统文化中，并没有创始元灵这个人物。而在小说《洪荒》中，混鲲祖师又曾受教于鸿钧老祖，因此混鲲祖师的师傅亦可以是鸿钧老祖。
